Una tabla periódica de tu coraje es el siguiente paso en la carrera para crear una píldora de caca que se alimenta de microbiomas.

Los científicos construyen una enorme base de datos con todas las bacterias del intestino humano después de identificar las nuevas especies que se encuentran en cada uno de nosotros.

Si padece una enfermedad digestiva como la de Crohn, existe un tratamiento de último recurso: el consumo de caca. Es una perspectiva desagradable, razón por la cual los científicos están trabajando arduamente para tratar de convertir la caca en una pastilla.

En este momento, si un médico quiere reemplazar las bacterias en nuestros intestinos, no hay ninguna inyección que pueda tomar ni una pastilla que pueda tomar. En cambio, existe un procedimiento conocido como trasplante de microbiota fecal (FMT). Esto significa literalmente transferir una muestra de heces de una persona sana a un paciente, a menudo a través de la boca, para que las bacterias «buenas» puedan transferirse al paciente.

Y en la carrera por encontrar alternativas, un grupo de científicos ha creado una vasta base de datos que cataloga las bacterias en el intestino. Pero antes de que puedas pasar de la caca a la píldora, debes comprender lo que sucede dentro de cada uno de nosotros.

Los científicos estiman que hay alrededor de 400 especies únicas de bacterias que se esconden en nuestro cuerpo. Rob Finn del Instituto Europeo de Bioinformática y sus colaboradores dirigidos por Trevor Lawley en el Instituto Wellcome Sanger han aislado con éxito 273 especies separadas por bacterias, incluidas 173 que nunca antes se habían secuenciado. Forman el conjunto de datos original, una tabla periódica que trabaja con todas las criaturas que se esconden en nuestro coraje.

La investigación, publicada en la revista Nature Biotechnology, se basa en 20 muestras fecales del Reino Unido y Canadá y podría conducir a hallazgos médicos auténticos. Entre las nuevas especies hay varios tipos de ramas de Clostridium difficile o C-Diff, y una mayor investigación al respecto podría algún día ayudar a las personas que padecen la enfermedad del intestino irritable y una serie de otras enfermedades.

«Todos los conocemos, o estamos empezando a comprenderlos todos», dice Finn, quien se refiere a las bacterias como si fueran humanos. «Creamos esa base de datos y una vez que tenemos la huella digital, podemos usar técnicas mucho más rápidas para comprender quién está presente en la siguiente persona».

Piense en ello como la aplicación de música Shazam. Solo escuche unos segundos de música y compárelo con una base de datos de millones de canciones, descubriendo rápidamente lo que está escuchando. Para canciones, lea bacterias.

«Con [new catalogue] probablemente solo necesite una décima parte de la cantidad de secuenciación ”, dice Finn. Una vez que las huellas dactilares coinciden con el registro en la base de datos, los científicos pueden confiar en qué especies están observando. Lo que fue una tarea laboriosa pronto podría lograrse mucho más rápido, ayudando a identificar de manera más efectiva las bacterias (o la falta de bacterias) en las muestras.

En última instancia, la esperanza es hacer que la base de datos cubra todas las bacterias que se encuentran en el intestino, pero esto plantea algunos desafíos importantes. «Simplemente llegó a nuestro conocimiento entonces [the database] probablemente representa el 20 por ciento de todas las bacterias intestinales, pero lo decimos con muchas advertencias ”, explica Finn.

La base de datos, tal como está actualmente, es un 50% más grande que los proyectos anteriores y contiene la mayoría de las bacterias más comunes, pero aún se cree que faltan muchas. «Nuestro conjunto de datos está realmente sesgado, porque tiende a provenir de América del Norte y Europa», explica Finn, y señala que el tamaño de la muestra es bastante pequeño, con solo 20 muestras fecales analizadas.

También es difícil averiguar exactamente qué se debe incluir. «Hay muchas bacterias que siempre están en el intestino y algunas simplemente las atraviesan. Quizás estoy en la comida que comes «, dice. «Por eso, necesitamos más muestras para crear una imagen completa. Hay bastantes otros por ahí. «

La esperanza es que algún día las especies individuales de bacterias puedan empaquetarse en píldoras, que es una forma más segura y rápida de tratar a los pacientes que necesitan un refuerzo bacteriano. «Hay mucho en la prensa sobre la importancia del intestino, el microbioma, para mantener la salud y hay una serie de diferentes enfermedades causadas por bacterias en el intestino. Este documento constituye la plataforma para obtener las bacterias que podemos utilizar para comenzar a abordar las preguntas en detalle sobre lo que hacen. «

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